選び抜かれた材料を、泡を立てずにじっくりと練り上げ、発酵させた後、一気にグラグラと煮え立つお湯の中でボイルする。
これがジュノエスクベーグルのおいしさの決め手。伝統的製法である茹でる工程をきちんと行うために、日本で唯一のボイルマシーンを考案（特許申請中）。
その日の温度・湿度によって微妙に変化するベーグル生地を、最高のタイミングで茹で上げ、専用かまどで焼き上げれば、表面は香ばしく、ちぎればもっちりと弾力のあるベーグルができあがります。
国内にベーグル専用の工房を持つのは、ジュノエスクベーグルだけ。製造法も特許申請中です。